Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GOLGA6L4A6NEF3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms