Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms