Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP68Q9UHB9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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