Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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