Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3AQ9NVI7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms