Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms