Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms