Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms