Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC45A3Q96JT2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms