Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms