Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A3Q92570 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A3Q92570 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms