Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms