Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLIP4Q8N3C7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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