Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM20Q6UY09 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms