Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms