Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA8Q53HL2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms