Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HSD17B12Q53GQ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms