Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL13BQ3SXY8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL13BQ3SXY8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms