Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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