Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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