Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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