Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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