Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPIDRQ14159 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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