Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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DDX39BQ13838 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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