Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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