Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL4AQ13619 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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CUL4AQ13619 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CUL4AQ13619 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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