Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms