Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms