Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGDP52209 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGDP52209 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms