Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms