Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms