Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJA4P35212 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJA4P35212 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GJA4P35212 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GJA4P35212 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GJA4P35212 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJA4P35212 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJA4P35212 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms