Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms