Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN3P20807 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms