Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RAB4AP20338 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms