Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA1P17302 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJA1P17302 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA1P17302 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA1P17302 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms