Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms