Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms