Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB6BQ9NRW1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms