Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

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Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KIAA1549Q9HCM3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KIAA1549Q9HCM3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KIAA1549Q9HCM3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KIAA1549Q9HCM3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KIAA1549Q9HCM3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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KIAA1549Q9HCM3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KIAA1549Q9HCM3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KIAA1549Q9HCM3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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