Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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