Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms