Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCGF6Q9BYE7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms