Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB11FIP5Q9BXF6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms