Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAD1Q99259 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms