Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC114Q96M63 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC114Q96M63 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms