Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTRA1Q92743 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms