Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL3Q8TAT5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms