Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms