Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms